More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3414 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  49.05 
 
 		 1057 aa  976    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.05 
 
 		 1056 aa  976    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  53.95 
 
 		 1064 aa  1085    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  53.58 
 
 		 1078 aa  1072    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  53.4 
 
 		 1058 aa  1072    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  41.4 
 
 		 1090 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  52.63 
 
 		 1072 aa  1056    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  54.12 
 
 		 1064 aa  1051    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  54.16 
 
 		 1068 aa  1092    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  42.25 
 
 		 1109 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  52.32 
 
 		 1055 aa  1060    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  45.75 
 
 		 1073 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  55.11 
 
 		 1082 aa  1077    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  42.57 
 
 		 1070 aa  843    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  42.58 
 
 		 1080 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1065 aa  928    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  53.28 
 
 		 1055 aa  1069    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  54.19 
 
 		 1060 aa  1095    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  54.16 
 
 		 1068 aa  1092    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  56.21 
 
 		 1064 aa  1159    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  46.95 
 
 		 1052 aa  892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  59.1 
 
 		 1072 aa  1186    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  56.26 
 
 		 1064 aa  1147    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  52.22 
 
 		 1055 aa  1060    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  57.57 
 
 		 1061 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  56 
 
 		 1061 aa  1179    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  54.76 
 
 		 1060 aa  1111    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  53.36 
 
 		 1081 aa  1061    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  53.77 
 
 		 1082 aa  1077    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  54.6 
 
 		 1063 aa  1129    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  42.6 
 
 		 1087 aa  812    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  42.94 
 
 		 1076 aa  827    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  52.7 
 
 		 1055 aa  1067    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  50.24 
 
 		 1057 aa  1039    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  51.23 
 
 		 1065 aa  1028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  57.05 
 
 		 1064 aa  1147    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1072 aa  997    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  55.11 
 
 		 1082 aa  1067    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 1462 aa  2923    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  58.02 
 
 		 1084 aa  1218    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  52.12 
 
 		 1055 aa  1058    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  52.92 
 
 		 1084 aa  1074    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  53.93 
 
 		 1065 aa  1086    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  58.02 
 
 		 1084 aa  1218    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  54.49 
 
 		 1076 aa  1083    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  59.47 
 
 		 1072 aa  1191    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  52.7 
 
 		 1055 aa  1068    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  54.4 
 
 		 1076 aa  1081    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  52.12 
 
 		 1055 aa  1058    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  58.02 
 
 		 1084 aa  1218    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  42.94 
 
 		 1076 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  55.11 
 
 		 1082 aa  1067    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  53.56 
 
 		 1082 aa  1078    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  69.89 
 
 		 1057 aa  1479    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  35.35 
 
 		 1044 aa  626  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 		 1460 aa  599  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.93 
 
 		 1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1075 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1095 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 		 1087 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1052 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1086 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1104 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  53.36 
 
 		 1122 aa  530  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1072 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1050 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1044 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1034 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1051 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1011 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.2 
 
 		 421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 1496 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1044 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1039 aa  397  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1470 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1041 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1039 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1032 aa  386  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1053 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1038 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1036 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1065 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1033 aa  376  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1034 aa  376  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1026 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.93 
 
 		 1069 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1067 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1064 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1075 aa  370  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1046 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1095 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1070 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1054 aa  367  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1055 aa  365  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.07 
 
 		 1049 aa  364  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1071 aa  363  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1054 aa  363  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>