More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0003 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 311 aa  641    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  30.42 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 169 aa  88.6  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.43 
 
 		 176 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  30.22 
 
 		 157 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 164 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  28.99 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 166 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  25.48 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  29.68 
 
 		 161 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 171 aa  79  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 166 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  23.51 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.93 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  28.15 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  30.08 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  30.08 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  30.08 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 151 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.09 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.57 
 
 		 159 aa  74.7  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.09 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  31.09 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  31.09 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.09 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  31.67 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  29.79 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  35.25 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.97 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  30.89 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.97 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 168 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.89 
 
 		 159 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  32.23 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  32.23 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.61 
 
 		 159 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.27 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  27.27 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  27.27 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 147 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.27 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 164 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 127 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.27 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  34.43 
 
 		 169 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  29.08 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  33.98 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  27.27 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 139 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 141 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  35.14 
 
 		 143 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.57 
 
 		 168 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 169 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  23.49 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 135 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>