More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2342 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  289  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  57.58 
 
 
209 aa  157  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  54.55 
 
 
211 aa  146  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  51.13 
 
 
216 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  51.13 
 
 
216 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  46.62 
 
 
215 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  45.86 
 
 
215 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  48.12 
 
 
256 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  49.24 
 
 
219 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  47.73 
 
 
214 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  46.21 
 
 
215 aa  126  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  43.18 
 
 
210 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  48.12 
 
 
223 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  43.18 
 
 
214 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  46.21 
 
 
210 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  44.7 
 
 
212 aa  116  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  45.04 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  42.42 
 
 
212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  43.61 
 
 
219 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  42.54 
 
 
224 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  44.36 
 
 
220 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  42.11 
 
 
221 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
225 aa  105  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  43.94 
 
 
217 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  44.09 
 
 
225 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
230 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  45.74 
 
 
227 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 
144 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  38.97 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  38.97 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  39.1 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
223 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 
232 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  39.53 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
216 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  39.44 
 
 
216 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
225 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  36.09 
 
 
217 aa  87  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  34.85 
 
 
202 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  37.59 
 
 
222 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  37.86 
 
 
282 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 
279 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  37.78 
 
 
214 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
279 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
769 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  37.88 
 
 
262 aa  80.9  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  42.64 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  38.36 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  36.22 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.43 
 
 
845 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.9 
 
 
223 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  42.64 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  42.64 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  38.35 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
873 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  42.64 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.08 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  31.3 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.99 
 
 
482 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  35.62 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  41.48 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  38.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  40.87 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  36.29 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 
315 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  34.62 
 
 
331 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
258 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  33.86 
 
 
614 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 
615 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  34.81 
 
 
214 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  36.11 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.91 
 
 
208 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  36 
 
 
290 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  38.46 
 
 
867 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  32.81 
 
 
865 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
279 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
863 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  37.21 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.86 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  35.43 
 
 
258 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>