More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1719 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1719  signal peptidase I  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1657  signal peptidase I  63.03 
 
 		 293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.330957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1359  signal peptidase I  41.2 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.562371  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1076  peptidase S26A, signal peptidase I  40.25 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  29.46 
 
 		 184 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  31.25 
 
 		 183 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  30.71 
 
 		 183 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  29.58 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  29.51 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  29.51 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  27.87 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  27.87 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  31.95 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  27.62 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  30.92 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  25.94 
 
 		 183 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  30 
 
 		 183 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  28.69 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  29.1 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  28.51 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  28.11 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  28.51 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  28.51 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0790  Signal peptidase I  28.12 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165061  hitchhiker  9.36355e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  28.51 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  28.11 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  28.11 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  28.11 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  28.57 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  28.45 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  28.92 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  27.89 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  28.87 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  29.57 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  28.29 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  29.57 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  28.87 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  28.87 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  28.87 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  28.87 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  27.95 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  27.67 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  32.38 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  29.18 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  29.29 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  27.89 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  27.27 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  28.92 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3767  signal peptidase I  27.27 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0219598  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  30.04 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  28.57 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  31.15 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  28.86 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  27.67 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  26.15 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  26.78 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  26.78 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  27.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  27.09 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  28.34 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  30 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  27.78 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.18 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  28.69 
 
 		 321 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  27.62 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  27.27 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  27.2 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  27.89 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  27.27 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  28.22 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  27.57 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  27.31 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  27.78 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  25.62 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  29.83 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1649  peptidase S26A, signal peptidase I  37.07 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.301306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  29.84 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  27.39 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  26.94 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  27.56 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  29.23 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  26.91 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  35.71 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  27.67 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  26.85 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  25 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2588  signal peptidase  28.4 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>