More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1401 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  100 
 
 		 372 aa  750    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.05 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  32.3 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  29.63 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  33.98 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  33.73 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  31.76 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0074  histidine kinase  35 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 815 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  34.29 
 
 		 1111 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 623 aa  123  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 827 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 621 aa  122  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 477 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 718 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 695 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 1185 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  33.33 
 
 		 493 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  29.92 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 412 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.48 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 621 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 489 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  34.53 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 844 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 608 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 452 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1084 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 754 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  26.72 
 
 		 498 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  31.43 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  33.05 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 844 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  37.12 
 
 		 633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 		 938 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.08 
 
 		 470 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0395  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 509 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 633 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  31.49 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  32.14 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 866 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.74 
 
 		 1629 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 932 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  31.69 
 
 		 557 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 460 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 507 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 644 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2423  histidine kinase  25.9 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 884 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 903 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 582 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 592 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.22 
 
 		 599 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 463 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 725 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 633 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  25.4 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  30.08 
 
 		 487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  29.91 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  33.05 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 887 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 892 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 920 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 3470 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1788 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 887 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  31.08 
 
 		 322 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 763 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  31.2 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 880 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>