51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5890 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5639  major royal jelly protein  85.29 
 
 		 401 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3405  major royal jelly protein  81.84 
 
 		 395 aa  650    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5890  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  802    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935584  normal  0.0771521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3279  hypothetical protein  83.16 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190693 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6245  hypothetical protein  58.89 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.832438 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5727  major royal jelly protein  54.47 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2448  hypothetical protein  42.12 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0125646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4095  hypothetical protein  41.78 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2714  hypothetical protein  42.24 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2931  hypothetical protein  38.5 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1436  hypothetical protein  39.34 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2718  hypothetical protein  37.99 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3083  major royal jelly protein  39.33 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.058624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1195  hypothetical protein  40 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3667  major royal jelly protein  36.59 
 
 		 343 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.801509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1432  major royal jelly protein  35.69 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0198  hypothetical protein  34.76 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0180894  normal  0.966346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4512  major royal jelly protein  34.95 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.551554  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2687  hypothetical protein  32.28 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4434  hypothetical protein  34.69 
 
 		 366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2121  putative major royal jelly-like protein  32.1 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0613  hypothetical protein  35.52 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.112882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0589  major royal jelly protein  36.23 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.0999995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0624  major royal jelly protein  34.35 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1158  major royal jelly protein  34.51 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1035  hypothetical protein  33.04 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1433  major royal jelly protein  33.43 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4481  hypothetical protein  32.65 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0686114  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0088  putative major royal jelly-like protein  30.25 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.898622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0307  hypothetical protein  31.44 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4323  major royal jelly protein  30.12 
 
 		 352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.230264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2974  major royal jelly protein  28.45 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3145  major royal jelly protein  28.45 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3892  major royal jelly protein  29.33 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3942  major royal jelly protein  28.91 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0089949  normal  0.0402088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1404  hypothetical protein  29.94 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2814  hypothetical protein  29.75 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1754  hypothetical protein  28.03 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4197  hypothetical protein  27.38 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598534  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1957  hypothetical protein  28.01 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5036  hypothetical protein  29.33 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1771  hypothetical protein  31.91 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35790  hypothetical protein  27.13 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1418  hypothetical protein  24.22 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2936  major royal jelly protein  23.45 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1409  hypothetical protein  25.18 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.5 
 
 		 1236 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.1 
 
 		 1652 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.6 
 
 		 1363 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 200 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>