156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5276 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  83.25 
 
 		 429 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  100 
 
 		 424 aa  843    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  80.19 
 
 		 430 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  79.76 
 
 		 463 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  77.99 
 
 		 420 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  53.06 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  45.04 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  40.33 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  39.75 
 
 		 415 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  39.71 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  39.75 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  39.03 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  39.58 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  38.36 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  37.53 
 
 		 422 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  39.6 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  37.44 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  36.85 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  38 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  35.38 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  27.73 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  30.3 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  27.07 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  32.16 
 
 		 485 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  31.28 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  34.85 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  29.55 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.24 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.24 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.09 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.4 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  29.41 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 		 504 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.44 
 
 		 445 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.33 
 
 		 458 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  32.37 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  27.83 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  29.53 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  32.41 
 
 		 439 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  28.97 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.12 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  29.06 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  28.93 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.11 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  26.02 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.04 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  26.25 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.85 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  35.19 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  23.52 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  28.9 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.5 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.44 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.4 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.12 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  26.13 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  26.1 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  25.51 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  49.12 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.49 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  44.26 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.13 
 
 		 1199 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  45.61 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  47.46 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  43.64 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  40.35 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  49.12 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  43.64 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  43.64 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  25.6 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  42.37 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  33.33 
 
 		 657 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.64 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  51.11 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  43.64 
 
 		 463 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  35.23 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  41.82 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  35.23 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  39.34 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  35.23 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  25.61 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  28.35 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  37.08 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  34.09 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  45.9 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  36.49 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  37.08 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  37.93 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  23.37 
 
 		 628 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  46.43 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  37.08 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  34.83 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  37.84 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>