87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4340 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4340  porin  100 
 
 		 314 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  51.74 
 
 		 299 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  50.31 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  51.13 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  45.22 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4552  porin  48 
 
 		 285 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  28.85 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4795  outer membrane insertion C-terminal signal  30.1 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.814191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  29.19 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  29.87 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  29.45 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1819  hypothetical protein  28.92 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4110  hypothetical protein  27.04 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  28.57 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  25.61 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  24.74 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  31.33 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  30.35 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.33 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  23.29 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  27.8 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  31.82 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  31.82 
 
 		 274 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.25 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  22.95 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.22 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.07 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  29.35 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.2 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  21.52 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  34.01 
 
 		 662 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  31.9 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.41 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  31.02 
 
 		 453 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  31.06 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  21.69 
 
 		 236 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  27.38 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28.3 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  29.44 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  25.09 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  32.4 
 
 		 997 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  32.74 
 
 		 248 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  29.61 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  26.73 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  33.55 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  29.32 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  22.56 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  28.57 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  28.87 
 
 		 583 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  29.94 
 
 		 577 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  32.89 
 
 		 689 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  33.54 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  25.84 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  30.85 
 
 		 452 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  30.82 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.79 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  24.89 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  25.93 
 
 		 724 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  27.84 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  29.87 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  24.92 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 571 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  27.6 
 
 		 670 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  26 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  24.82 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  30.06 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  30.06 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  30.19 
 
 		 570 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  35.19 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  29.63 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  30.38 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  25.26 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  23.49 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  29.3 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  26.99 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  30.92 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  37.61 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2010  carbohydrate-selective porin OprB  31.87 
 
 		 703 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  28.3 
 
 		 710 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.43 
 
 		 207 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2286  Carbohydrate-selective porin OprB  31.98 
 
 		 703 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.725177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  35.79 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  29.26 
 
 		 693 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  24.83 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.7 
 
 		 1186 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  32.43 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  28.1 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>