30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1819 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1819  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1117  hypothetical protein  37.84 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1310  hypothetical protein  37.72 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4110  hypothetical protein  34.58 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.2521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2970  hypothetical protein  35.23 
 
 		 276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3911  hypothetical protein  38.35 
 
 		 264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4795  outer membrane insertion C-terminal signal  38.3 
 
 		 263 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.814191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  30 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  31.61 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4552  porin  29.63 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.477499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3063  porin  27.56 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4835  porin  29.15 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4340  porin  28.92 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  24.47 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25.66 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  23.82 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  25.49 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  25.38 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  24.51 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  23.97 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.44 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.44 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.15 
 
 		 452 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  24.81 
 
 		 236 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  23.64 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  26.57 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  25 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.4 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.95 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  27.37 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>