111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1214 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
632 aa  1298    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  47.05 
 
 
673 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  57.82 
 
 
696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  58.17 
 
 
673 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00985  hypothetical protein  30.89 
 
 
648 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3989  hypothetical protein  34.15 
 
 
391 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24687  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
400 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  27.61 
 
 
409 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
403 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  31.2 
 
 
354 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3999  hypothetical protein  26.65 
 
 
666 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.954814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
760 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.14 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  28.8 
 
 
399 aa  69.7  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1311  hypothetical protein  28.46 
 
 
655 aa  67.4  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
1348 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
499 aa  63.9  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
389 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 
402 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.81 
 
 
397 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  27.56 
 
 
1199 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  29.92 
 
 
364 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.84 
 
 
394 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  27.56 
 
 
1199 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 
1156 aa  60.5  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  24.26 
 
 
370 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  25.68 
 
 
537 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.21 
 
 
700 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.95 
 
 
860 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
387 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
388 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
994 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
397 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  26.8 
 
 
402 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0590  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
414 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  31.54 
 
 
1837 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1075  hypothetical protein  27.04 
 
 
411 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
432 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
403 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
404 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
1340 aa  54.3  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
406 aa  54.3  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
415 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  25.7 
 
 
537 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
417 aa  53.9  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  24.73 
 
 
413 aa  53.9  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
703 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
274 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  21.83 
 
 
376 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
410 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
683 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 
410 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 
408 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
433 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
409 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
410 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
535 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  21.66 
 
 
402 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 
892 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
824 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  42.62 
 
 
387 aa  50.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  41.54 
 
 
399 aa  50.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
405 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
411 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
409 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
1075 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  31.76 
 
 
399 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
405 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
413 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
406 aa  48.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
391 aa  48.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
415 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0934  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
443 aa  48.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
902 aa  47.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  37.88 
 
 
396 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
374 aa  47.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
414 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
406 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  23.95 
 
 
443 aa  47.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  43.4 
 
 
404 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
394 aa  47.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  28.35 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  23.41 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
360 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  29.82 
 
 
413 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  26.19 
 
 
415 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 
401 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
1152 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  33.8 
 
 
405 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
421 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.11 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>