More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0915 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0915  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
237 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0866408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2065  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.35 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0111097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63.03 
 
 
229 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63.45 
 
 
231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63.03 
 
 
231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0446  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  60.17 
 
 
235 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1888  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.58 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0266  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.89 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.92 
 
 
227 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3136  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.43 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0838279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.39 
 
 
241 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4420  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.39 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314692  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1391  hypothetical protein  37.39 
 
 
238 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0338274  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0010  membrane efflux protein  37.39 
 
 
412 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1407  MarC membrane protein  37.39 
 
 
412 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1493  putative membrane efflux protein  37.39 
 
 
412 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1320  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.29 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.93 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0344188  normal  0.129693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5311  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.09 
 
 
225 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500133  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3841  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.29 
 
 
227 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5777  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.29 
 
 
227 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782432  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.29 
 
 
227 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1297  multiple antibiotic resistance (MarC)- related proteins  36.56 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00195528  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0153  hypothetical protein  34.87 
 
 
215 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0431  hypothetical protein  34.87 
 
 
215 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1193  hypothetical protein  34.87 
 
 
234 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4212  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.07 
 
 
220 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420393  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1147  hypothetical protein  34.87 
 
 
234 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4291  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.28 
 
 
227 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.07 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3203  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.07 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6440  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.65 
 
 
240 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.17 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0573  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.74 
 
 
227 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3885  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.48 
 
 
233 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1634  multiple drug resistance protein MarC  30.52 
 
 
221 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.760393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1649  multiple drug resistance protein MarC  30.52 
 
 
221 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0716145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1693  multiple drug resistance protein MarC  30.52 
 
 
221 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1626  multiple drug resistance protein MarC  30.52 
 
 
221 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1814  multiple drug resistance protein MarC  30.05 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3217  multiple drug resistance protein MarC  27.04 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.61 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1110  multiple drug resistance protein MarC  28.21 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1641  multiple drug resistance protein MarC  29.17 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1999  multiple drug resistance protein MarC  29.3 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.41 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1871  multiple antibiotic resistance protein  26.48 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126971  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2141  multiple drug resistance protein MarC  28.37 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0214276  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1676  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01486  predicted transporter  28.7 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2117  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.7 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.37 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1731  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01497  hypothetical protein  28.7 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2143  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1611  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2129  multiple drug resistance protein MarC  28.7 
 
 
221 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0936  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.04 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19439  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  26.11 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.43 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68750  multiple drug resistance protein MarC  27.85 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.39 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5951  multiple drug resistance protein MarC  27.43 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  27.44 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0053  multiple drug resistance protein MarC  28.64 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  28.26 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.22 
 
 
205 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  27.78 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  27.19 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.28 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  26.84 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.57 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  22.48 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2628  multiple drug resistance protein MarC  27.52 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000653473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1817  multiple drug resistance protein MarC  27.52 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  26.7 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1707  multiple drug resistance protein MarC  27.52 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0501787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  26.5 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.71 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.38 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  26.32 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.44 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.13 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  26.17 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  25.46 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  25.7 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  25.81 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  23.96 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>