74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  64.29 
 
 		 70 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 70 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0604  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.86 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.050819  normal  0.048745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.43 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.07 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.67 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  42.65 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.14 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.67 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.06 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.29 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.47 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.25 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.44 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  38.57 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.35 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.21 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  29.58 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1143  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.21 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0193117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  29.73 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.18 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.99 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.14 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.66 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0494  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.18 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  35.21 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  34.29 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  37.14 
 
 		 66 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  37.14 
 
 		 70 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1415  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 		 73 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2380  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.8 
 
 		 77 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  29.17 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  29.17 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  36.62 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  29.17 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  29.17 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  29.17 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.9 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  35.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  28.57 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  33.8 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  41.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  32.86 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  33.78 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.78 
 
 		 78 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.57 
 
 		 70 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1567  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.19 
 
 		 70 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0927969  normal  0.455632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>