141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5196 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  90.78 
 
 
573 aa  1032    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  65.59 
 
 
519 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  100 
 
 
573 aa  1155    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  91.3 
 
 
573 aa  1020    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  68.44 
 
 
530 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5407  peptidase S10 serine carboxypeptidase  63.69 
 
 
526 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451508  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5174  putative peptidase S10, serine carboxypeptidase  50.11 
 
 
534 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  49.57 
 
 
514 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  50 
 
 
522 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2967  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.99 
 
 
517 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1122  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.25 
 
 
522 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.06 
 
 
511 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0347  peptidase S10 serine carboxypeptidase  45.33 
 
 
521 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0440  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.66 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  47.66 
 
 
573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1336  peptidase S10 serine carboxypeptidase  47.14 
 
 
533 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  43.28 
 
 
498 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  42.68 
 
 
490 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0563  peptidase S10 serine carboxypeptidase  42.64 
 
 
508 aa  352  8.999999999999999e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.854374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0609  carboxypeptidase related protein  42.58 
 
 
503 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0684  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.19 
 
 
513 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0948758  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.96 
 
 
510 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.67 
 
 
511 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.58 
 
 
590 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  34.79 
 
 
573 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.56 
 
 
492 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.53 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  33.61 
 
 
551 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.56 
 
 
510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.07 
 
 
554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.47 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.94 
 
 
514 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.38 
 
 
561 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.51 
 
 
502 aa  208  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  33.88 
 
 
554 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.27 
 
 
490 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.95 
 
 
558 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.99 
 
 
558 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.26 
 
 
524 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.64 
 
 
558 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.62 
 
 
499 aa  203  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.64 
 
 
558 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.64 
 
 
558 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  32.44 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  33.4 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.47 
 
 
558 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.78 
 
 
516 aa  200  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.78 
 
 
516 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.15 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.04 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.52 
 
 
558 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.36 
 
 
516 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.83 
 
 
494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.59 
 
 
517 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30 
 
 
494 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.37 
 
 
513 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.07 
 
 
533 aa  193  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.01 
 
 
513 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.46 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.75 
 
 
500 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.16 
 
 
513 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.95 
 
 
513 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0790  carboxypeptidase S1  29.07 
 
 
481 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  32.05 
 
 
517 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  32.25 
 
 
543 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.33 
 
 
544 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 
613 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.74 
 
 
614 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  32.38 
 
 
615 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
615 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
615 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
615 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
615 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
619 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  32.38 
 
 
615 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.52 
 
 
492 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.54 
 
 
613 aa  180  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  29.17 
 
 
503 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  30.59 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.76 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  31.22 
 
 
611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.02 
 
 
611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.02 
 
 
611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.43 
 
 
611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.65 
 
 
487 aa  174  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.35 
 
 
514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0326  serine-type carboxypeptidase family protein  29.35 
 
 
567 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0561  serine-type carboxypeptidase family protein  29.98 
 
 
549 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.06 
 
 
536 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.06 
 
 
536 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0373  serine carboxypeptidase family protein  29.31 
 
 
563 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0393  serine carboxypeptidase family protein  29.31 
 
 
563 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.06 
 
 
536 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2223  serine-type carboxypeptidase family protein  29.16 
 
 
585 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0975  serine carboxypeptidase family protein  28.92 
 
 
575 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>