136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5116 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
127 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  78.74 
 
 
127 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  77.95 
 
 
127 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 
270 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  41.67 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.71 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.71 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  36.8 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  35.83 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  35 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.62 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  33.93 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  31.25 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  32.8 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  38.16 
 
 
127 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
132 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  38.16 
 
 
127 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  38.16 
 
 
127 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  35.9 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  32.73 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  33.93 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  35.92 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  33.6 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  38.46 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  31.71 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  27.35 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  39.19 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  29.17 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  39.19 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  28.46 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.53 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 
122 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
129 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36 
 
 
130 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  34.83 
 
 
123 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  31.18 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  34.62 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  28.46 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.53 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  31.93 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  34.04 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  30.95 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  32.98 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  28.57 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  35.24 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  33.75 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  30.58 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  32.41 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  31.91 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  31.91 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  32.1 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  31.91 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  33.82 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  28.72 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  29.63 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  33.93 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  41.03 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0135  hypothetical protein  30.97 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  31.18 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  36.21 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  34.21 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  34.04 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>