43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3429 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  93.65 
 
 		 252 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  93.65 
 
 		 252 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  68.7 
 
 		 250 aa  328  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  67.83 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  67.36 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  37.44 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  37.11 
 
 		 209 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  36.18 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  36.26 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  36.26 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.52 
 
 		 658 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  35.18 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  36.16 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  31.79 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  33.67 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  33.96 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  35.79 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  32.73 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  32.27 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  33.16 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  30.22 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  31.25 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  35.8 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  36.45 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  29.7 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  34.98 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  34.98 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  27.37 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  29.84 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  32.39 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  31.31 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  25.24 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  24.76 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  30.37 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  28.9 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  26.69 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  25.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  27.06 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  29.8 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  25.12 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  26.51 
 
 		 253 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>