134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2953 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2953  CheW protein  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2835  CheW domain-containing protein  86.98 
 
 		 195 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3061  CheW protein  87.13 
 
 		 166 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2182  CheW protein  54.11 
 
 		 164 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5449  CheW protein  51.25 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.470199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0240  CheW protein  51.25 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00382894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  35.98 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  20.92 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  21.84 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  30.4 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  24.09 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  31.91 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  31.69 
 
 		 170 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  28.86 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  23.85 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  23.03 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  27.94 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  27.15 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.83 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  28.85 
 
 		 533 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.83 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.83 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.53 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.83 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.5 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  25.87 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.44 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  24.83 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.83 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.51 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  27.46 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  27.46 
 
 		 308 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  25.98 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  22.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  26.95 
 
 		 311 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  27.01 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.68 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.21 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  26.95 
 
 		 311 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  25.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  21.94 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  25.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  21.94 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  25.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  25.81 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.09 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  25.32 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  31.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.47 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25.81 
 
 		 161 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  26.72 
 
 		 466 aa  44.7  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  24.22 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  34.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  24.22 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3680  CheW protein  32.52 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  24.44 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  26.43 
 
 		 311 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  30.4 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  25.23 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  27.91 
 
 		 146 aa  44.7  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.71 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  26.53 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  23.08 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.71 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.22 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  25 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.71 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.71 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  26.24 
 
 		 311 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  29.5 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  29.17 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  25.17 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4576  CheW protein  31.54 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0407395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  27.45 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  26.17 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5514  CheW protein  32.52 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0719393  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3787  CheW protein  31.54 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0686747  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  25.17 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  22.06 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  25.17 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  25.17 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  33.78 
 
 		 317 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.74 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  25.47 
 
 		 309 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  26.24 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  27.74 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.22 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  28.15 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  23.57 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  26.03 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  26.81 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  26.03 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.62 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  19.74 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  26.81 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  29.73 
 
 		 568 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  25.17 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  27.22 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>