More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1240 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  93.9 
 
 
213 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  58.94 
 
 
210 aa  250  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3155  hypothetical protein  48.33 
 
 
207 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.476319 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.41 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  43.48 
 
 
212 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  42.86 
 
 
197 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  40.38 
 
 
219 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  40.38 
 
 
220 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  37.56 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  38.31 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  39.9 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 
198 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 
214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  36.27 
 
 
214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 
214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  38.42 
 
 
208 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
203 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  38.73 
 
 
207 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 
209 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  35 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  32.68 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  32.18 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  36.89 
 
 
297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  36.89 
 
 
300 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  36.89 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  36.89 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  36.89 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  36.89 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
209 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  37.38 
 
 
217 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  33.98 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  35.96 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
227 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  35.75 
 
 
225 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
205 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.63 
 
 
221 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  32.52 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 
205 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  30.88 
 
 
220 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  33 
 
 
213 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.98 
 
 
205 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 
205 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  32.52 
 
 
203 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  32.5 
 
 
203 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 
203 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 
203 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.16 
 
 
203 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  32.85 
 
 
219 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
205 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  32.04 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  29.15 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  27.36 
 
 
206 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  34.58 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  31.78 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  29.44 
 
 
210 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2641  Glutathione S-transferase domain  32.72 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.213293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  29.33 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  34.1 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  30.96 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  34.65 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  31.31 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  31.31 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  32.72 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  27.05 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3756  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  33.64 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0974  Glutathione S-transferase domain protein  27.49 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  33.18 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29.74 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0837  glutathione S-transferase domain protein  28.16 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  30.29 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.43 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  29.23 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  26.29 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  26.26 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  31.13 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  32.35 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  33.17 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  26.13 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  25.35 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  28.26 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  33.5 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>