More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0087 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  31.63 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  34.58 
 
 		 517 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  32.21 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  29.85 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.78 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  31.73 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  31.73 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  31.36 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  36.79 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  31.07 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  30.15 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  33.96 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.12 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  32.35 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  36.08 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  34.72 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  34.81 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 455 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.95 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  30.81 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  32.31 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  32.29 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 415 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  36.73 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 408 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 378 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 		 425 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.7 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.39 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.02 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.37 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.41 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  28.92 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 544 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  32.2 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.59 
 
 		 505 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  28.81 
 
 		 369 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  24.78 
 
 		 292 aa  89  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  30.3 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  34.54 
 
 		 358 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.09 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  32.43 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 509 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 412 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  31.84 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.41 
 
 		 912 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3375  putative signal transduction protein  32.54 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  29.32 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  31.73 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.57 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.08 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.39 
 
 		 716 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  28.1 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.42 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  29.27 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>