More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2203 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  100 
 
 
438 aa  869    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  63.72 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  58.74 
 
 
416 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  59.44 
 
 
416 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  58.29 
 
 
422 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  58.24 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  58.24 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  58.29 
 
 
577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  58.24 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  58.06 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  58.47 
 
 
420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  58.24 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  58.24 
 
 
420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  59.07 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  57.11 
 
 
416 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  57.58 
 
 
496 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  57.34 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  57.34 
 
 
416 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  57.58 
 
 
416 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  57.11 
 
 
416 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  56.18 
 
 
416 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  45.39 
 
 
425 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  46.57 
 
 
420 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  44.65 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  45.56 
 
 
416 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  43.09 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  42.49 
 
 
425 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  42.96 
 
 
417 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  41.92 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  41.4 
 
 
421 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  42.49 
 
 
417 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  40.97 
 
 
423 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  40.74 
 
 
423 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  40.74 
 
 
423 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  42.02 
 
 
417 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  40.38 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  45.99 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  40.28 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  46.76 
 
 
418 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  40.14 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  43.72 
 
 
419 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  41.78 
 
 
419 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  42.89 
 
 
417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  42.02 
 
 
421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  43.09 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  43.09 
 
 
415 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  42.86 
 
 
415 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  41.31 
 
 
421 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  41.03 
 
 
418 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  37.56 
 
 
428 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  44.65 
 
 
415 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  40.56 
 
 
415 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  41.69 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  36.68 
 
 
419 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  36.61 
 
 
420 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  36.3 
 
 
412 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.02 
 
 
425 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  29.79 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  36.49 
 
 
414 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  36 
 
 
412 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  36.49 
 
 
414 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  27.73 
 
 
421 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  29.86 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.65 
 
 
423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  31.84 
 
 
423 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  33.41 
 
 
418 aa  179  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  30.8 
 
 
450 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  31.83 
 
 
452 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.41 
 
 
450 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  30.8 
 
 
450 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  30.8 
 
 
450 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  30.06 
 
 
454 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.1 
 
 
430 aa  176  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  29.96 
 
 
450 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  29.96 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  29.15 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.96 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  33.48 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  29.96 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  30.21 
 
 
449 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  30.02 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  29.57 
 
 
450 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  28.66 
 
 
450 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  29.81 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  29.81 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  29.81 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  29.81 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  30.02 
 
 
450 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  30.02 
 
 
450 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  29.6 
 
 
450 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  29.6 
 
 
450 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  30.37 
 
 
468 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  28.93 
 
 
456 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  33.26 
 
 
428 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  31.28 
 
 
490 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  30.21 
 
 
455 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  31.28 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  30.79 
 
 
490 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  31.03 
 
 
489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  32.05 
 
 
461 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>