More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0987 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 
305 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  60.48 
 
 
293 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  55.52 
 
 
303 aa  345  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  56.95 
 
 
310 aa  334  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  50.31 
 
 
310 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  50.63 
 
 
310 aa  295  8e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  47.6 
 
 
326 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  47.9 
 
 
312 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  48.4 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  50 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  46.62 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  47.57 
 
 
332 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  46.33 
 
 
339 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  47.71 
 
 
340 aa  275  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  46.86 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  48 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
315 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  45.25 
 
 
328 aa  265  7e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.34 
 
 
317 aa  257  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.21 
 
 
317 aa  252  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
313 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  44.41 
 
 
309 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  43.61 
 
 
322 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  46.05 
 
 
311 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  40.19 
 
 
323 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  43.09 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
328 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  43.05 
 
 
373 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  43.2 
 
 
304 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  43.04 
 
 
306 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  43.42 
 
 
351 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  43.42 
 
 
304 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  43.42 
 
 
304 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  43.42 
 
 
351 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  43.73 
 
 
304 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  43.42 
 
 
304 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  42.57 
 
 
326 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  43.73 
 
 
304 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  44.07 
 
 
304 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  43.09 
 
 
304 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  44.14 
 
 
345 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  44.15 
 
 
304 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  42.72 
 
 
304 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  44.26 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  43.69 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  41.42 
 
 
320 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  43.14 
 
 
344 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  42.57 
 
 
304 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.52 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  43.25 
 
 
342 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  42.33 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  42.81 
 
 
308 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  40.13 
 
 
327 aa  230  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  41.31 
 
 
303 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  42.43 
 
 
314 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  43 
 
 
307 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  44.26 
 
 
309 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  44.26 
 
 
309 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.45 
 
 
320 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  42 
 
 
314 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.61 
 
 
328 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
311 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  42.63 
 
 
310 aa  225  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  42.57 
 
 
312 aa  225  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  40.92 
 
 
305 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
339 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  42.81 
 
 
323 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.83 
 
 
328 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
329 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  44.44 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.25 
 
 
305 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
308 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.66 
 
 
343 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 
334 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.26 
 
 
282 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  42.57 
 
 
304 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  38.64 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  40.59 
 
 
305 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  39.93 
 
 
325 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 
324 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.72 
 
 
323 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
279 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 
308 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
323 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.92 
 
 
321 aa  209  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.2 
 
 
337 aa  208  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.51 
 
 
309 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.56 
 
 
310 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
320 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  36.22 
 
 
300 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
327 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  42.48 
 
 
275 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 
308 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
322 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
266 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 
326 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>