More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0254 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  39.85 
 
 		 1089 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  40.45 
 
 		 1078 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  39.74 
 
 		 1062 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  38.33 
 
 		 1132 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  40.1 
 
 		 1050 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  37.99 
 
 		 1075 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1232 aa  2459    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  43 
 
 		 1032 aa  763    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  38.59 
 
 		 1001 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  37.57 
 
 		 1082 aa  635  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.87 
 
 		 1089 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  41.83 
 
 		 1124 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  40.08 
 
 		 1161 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  36.76 
 
 		 1127 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  35.49 
 
 		 1174 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  34.27 
 
 		 1033 aa  558  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  38.54 
 
 		 1027 aa  558  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  49.2 
 
 		 1067 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  53.62 
 
 		 408 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  53.03 
 
 		 1156 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  52.69 
 
 		 428 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  51.44 
 
 		 1244 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  53.24 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  50.34 
 
 		 411 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.8 
 
 		 411 aa  432  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  46.07 
 
 		 414 aa  410  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  44.12 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31 
 
 		 785 aa  333  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  35.49 
 
 		 706 aa  332  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.8 
 
 		 732 aa  331  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  34.26 
 
 		 739 aa  330  9e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.29 
 
 		 763 aa  329  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.89 
 
 		 729 aa  328  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 744 aa  328  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.91 
 
 		 754 aa  326  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 705 aa  326  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  35.11 
 
 		 726 aa  326  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.45 
 
 		 781 aa  325  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.65 
 
 		 773 aa  321  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 741 aa  320  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.09 
 
 		 729 aa  319  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 736 aa  319  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  33.75 
 
 		 787 aa  318  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  33.24 
 
 		 738 aa  317  7e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 		 768 aa  317  7e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.7 
 
 		 806 aa  317  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.79 
 
 		 725 aa  317  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 738 aa  316  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.27 
 
 		 738 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 688 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.85 
 
 		 742 aa  314  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 		 795 aa  314  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.95 
 
 		 730 aa  312  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.88 
 
 		 794 aa  313  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.95 
 
 		 730 aa  312  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.76 
 
 		 715 aa  312  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.38 
 
 		 786 aa  311  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  32.59 
 
 		 732 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.28 
 
 		 741 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  32.44 
 
 		 731 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.11 
 
 		 768 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.25 
 
 		 741 aa  308  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.75 
 
 		 756 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.36 
 
 		 747 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.36 
 
 		 751 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  33.1 
 
 		 723 aa  305  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.36 
 
 		 751 aa  305  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  30.36 
 
 		 753 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  30.36 
 
 		 751 aa  305  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.36 
 
 		 747 aa  305  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.36 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.06 
 
 		 858 aa  304  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 		 728 aa  304  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.03 
 
 		 837 aa  304  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  31.75 
 
 		 720 aa  304  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.17 
 
 		 753 aa  304  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.17 
 
 		 753 aa  303  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  31.62 
 
 		 720 aa  304  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.16 
 
 		 830 aa  303  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  34.79 
 
 		 707 aa  303  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.21 
 
 		 747 aa  303  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  32.68 
 
 		 727 aa  303  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.97 
 
 		 833 aa  303  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.1 
 
 		 725 aa  301  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.03 
 
 		 737 aa  301  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.6 
 
 		 892 aa  301  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  33.29 
 
 		 742 aa  300  9e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.69 
 
 		 851 aa  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  32.55 
 
 		 720 aa  299  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  30.78 
 
 		 720 aa  298  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  30.92 
 
 		 720 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  30.92 
 
 		 720 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  30.78 
 
 		 720 aa  298  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  30.92 
 
 		 720 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  31.88 
 
 		 722 aa  298  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  30.92 
 
 		 720 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  30.92 
 
 		 720 aa  299  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  30.64 
 
 		 720 aa  298  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  30.78 
 
 		 720 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.66 
 
 		 762 aa  299  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>