More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8012 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8012  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  86.83 
 
 
281 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0117  extracellular solute-binding protein  39.42 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3310  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 
280 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 
274 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.72 
 
 
278 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.46 
 
 
280 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21410  ABC transporter, substrate binding protein, family 3  31 
 
 
292 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1129  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.42 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.1 
 
 
274 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
279 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.19 
 
 
272 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.96 
 
 
305 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
286 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
292 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.86 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5767  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
272 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.86 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1889  extracellular solute-binding protein family 3  35.81 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
275 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 
262 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.33 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  31.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
271 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.92 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.63 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.37 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  30.7 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  30.7 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  26.4 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.87 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  33.16 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.02 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  31.69 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1517  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0341163  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5541  extracellular solute-binding protein family 3  32.26 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  30.73 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  27.69 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.78 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30.73 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.28 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30.73 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  32.64 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  30.81 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.63 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  30.81 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  30.81 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  37.1 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  30.23 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.92 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  28.08 
 
 
298 aa  72  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.11 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5265  extracellular solute-binding protein family 3  32.26 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4514  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.968225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>