64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7310 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  100 
 
 
191 aa  358  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  95.29 
 
 
191 aa  289  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  66.67 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  69.66 
 
 
212 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  68.16 
 
 
213 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  67.6 
 
 
214 aa  226  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  67.6 
 
 
214 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  68.64 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  64.8 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  65.03 
 
 
213 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  52.17 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  46.78 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  50.32 
 
 
269 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  50.32 
 
 
269 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  50.32 
 
 
269 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  47.47 
 
 
253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  47.47 
 
 
253 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  47.02 
 
 
171 aa  141  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  47.77 
 
 
158 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  48.99 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  45.25 
 
 
290 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  40.94 
 
 
260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  38.71 
 
 
304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  44.03 
 
 
158 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  38.69 
 
 
575 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  36.31 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  33.76 
 
 
160 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  35.44 
 
 
160 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  35.26 
 
 
160 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  33.92 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  38.12 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  33.54 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  30.66 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  40.83 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  32.5 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  32.5 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  36.56 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  29.78 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  28.86 
 
 
227 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  36.75 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  28.97 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  34.81 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  27.88 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  32.1 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  31.78 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  34.17 
 
 
203 aa  55.1  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  30.82 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  35.25 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  35.04 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  26.92 
 
 
185 aa  51.2  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  32.77 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  28.47 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1360  hypothetical protein  33.65 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00314965  hitchhiker  7.76106e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  28.83 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  42.62 
 
 
107 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  34.59 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  27.57 
 
 
192 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  29.03 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>