56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1757 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  69.31 
 
 		 203 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  72.91 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  64.85 
 
 		 203 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  64.85 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  66.5 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  64.04 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  32.42 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  32.42 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  31.47 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  33.14 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  34.84 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  33.14 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  33.14 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  34.22 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  29.59 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  29.83 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  40.98 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  40.83 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  40.16 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  40.16 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  32.76 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  33.73 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  40 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  40 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  34.04 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  37.39 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  39.17 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  32.82 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  27.45 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  30.18 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  27.88 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  30.59 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  33.09 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  29.59 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  29.59 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  29.59 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  35.9 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  35.65 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  27.84 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  27.22 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  30.34 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  27.63 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  27.63 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  31.01 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  33.52 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  28.29 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  29.55 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  30.29 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  27.27 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  35.71 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>