52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1717 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  376  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  49.71 
 
 		 180 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  55.11 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  49.71 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  47.73 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  47.16 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  47.16 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  47.16 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  46.02 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  42.94 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  37.78 
 
 		 158 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  40.31 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  33.71 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  33.59 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  35.54 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  35.54 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  37.31 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  33.92 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  32.93 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  29.85 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  29.85 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  29.85 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  31.43 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  35.43 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  33.08 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  30.51 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  31.4 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  34.88 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  30.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  32.63 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  37.61 
 
 		 290 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  34.65 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  32.2 
 
 		 168 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  34.31 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  30.3 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  35.07 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  34.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  28.97 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  30.95 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  27.22 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  35.34 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  31.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  34.26 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  37.89 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>