62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0666 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  383  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  383  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  66.3 
 
 		 196 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  47.92 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  35.19 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  32.47 
 
 		 205 aa  84.7  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  38.98 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  38.98 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  38.98 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  35.33 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  28.3 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  34 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  34.67 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  32.67 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  32.48 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  32.89 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  31.37 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  31.17 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  32.24 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  32.34 
 
 		 213 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  34.46 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  30.72 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  30.72 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  33.93 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  38.46 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  32.04 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  31.19 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  32.04 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  26.92 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  31.3 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  26.97 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  29.55 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  29.44 
 
 		 192 aa  51.6  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  28.16 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  33.58 
 
 		 304 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  31.74 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  27.45 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  25.23 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  26.45 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  25.79 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  25.71 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  27.59 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  26.63 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  28.87 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  27.63 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  24.68 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>