63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6576 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  100 
 
 		 191 aa  362  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  95.29 
 
 		 191 aa  290  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  67.6 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  64.48 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  67.42 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  65.92 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  65.92 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  66.27 
 
 		 213 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  63.13 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  62.84 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  51.09 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  46.2 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  49.68 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  49.68 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  49.68 
 
 		 269 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  47.02 
 
 		 171 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  47.13 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  45.57 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  45.57 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  48.99 
 
 		 220 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  44.13 
 
 		 290 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  40.94 
 
 		 260 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  38.71 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  44.3 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  36.31 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  35.03 
 
 		 160 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  36.31 
 
 		 575 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  35.44 
 
 		 160 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  35.26 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  34.18 
 
 		 160 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  36.88 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  29.03 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  31.87 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  31.87 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  30.34 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  40.83 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  29.21 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  37.1 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  29.35 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  35.9 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  33.88 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  34.45 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  34.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  34.75 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  29.46 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  27.74 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  29.03 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  40.32 
 
 		 107 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  30.83 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1360  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00314965  hitchhiker  7.76106e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  27.57 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>