53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0018 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  99.44 
 
 
177 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  97.18 
 
 
173 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  56.32 
 
 
180 aa  217  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  56 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  52.02 
 
 
179 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  47.73 
 
 
189 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  43.2 
 
 
180 aa  140  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  39.34 
 
 
158 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  40.32 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  40.65 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  34.29 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  36.07 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  30.48 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  30.48 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  36.07 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  34.92 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  34.59 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  30.18 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  33.83 
 
 
203 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  32.58 
 
 
269 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  32.58 
 
 
269 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  32.58 
 
 
269 aa  57.8  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  29.41 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  32.09 
 
 
227 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  29.48 
 
 
203 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  31.76 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  31.76 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  33.59 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  32.81 
 
 
214 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  38.78 
 
 
253 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  28.99 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  32.81 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  38.78 
 
 
253 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  32.81 
 
 
213 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  34.15 
 
 
252 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  32.09 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  32.03 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  30 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  25.41 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  30.08 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  38.95 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  31.25 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  27.98 
 
 
196 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  33.61 
 
 
575 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>