46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0018 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  360  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  97.74 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  97.74 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  97.74 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  97.18 
 
 		 177 aa  353  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  55.17 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  53.71 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  49.71 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  46.02 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  41.42 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  39.34 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  37.29 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  35.59 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  38.66 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  34.11 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  33.92 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  28.96 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  30.43 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  27.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  31.97 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  26.49 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  27.22 
 
 		 203 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  30.72 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  30.72 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  31.97 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  29.92 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  29.92 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  29.92 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  27.17 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  28.48 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  26.32 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  31.71 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  30.6 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  41.67 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  41.67 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  30.3 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  30.89 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  30.08 
 
 		 214 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  30.08 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  31.93 
 
 		 252 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  30.08 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>