52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2944 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  98.03 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  79.8 
 
 		 203 aa  351  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  64.85 
 
 		 203 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  65.84 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  66.83 
 
 		 203 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  59 
 
 		 202 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  34.44 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  33.72 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  33.76 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  31.32 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  34.34 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  34.34 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  34.34 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  27.94 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  40 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  35.59 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  39.83 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  39.17 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  30.18 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  39.17 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  30.46 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  39.17 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  34.92 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  36.15 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  36.15 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  36.15 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  37.61 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  37.61 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  35.9 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  29.47 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  31.38 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  34.96 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  34.21 
 
 		 575 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  34.45 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  31.45 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  32.28 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  37.08 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  29.77 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  31.06 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  26.45 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  26.45 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  30.15 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  28.4 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  30.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  32.73 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  35.23 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  28.03 
 
 		 160 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>