55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3975 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  67.82 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  66.83 
 
 		 203 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  65.84 
 
 		 203 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  64.04 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  61.81 
 
 		 202 aa  245  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  65.02 
 
 		 203 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 176 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  31.96 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  42.11 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  45.6 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  45.6 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  45.6 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  45.6 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  38.41 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  44.8 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  44.8 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  38.78 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  37.29 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  37.29 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  39.06 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  39.06 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  39.06 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  36.7 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  29.95 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  36.76 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  40.83 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  37.4 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  37.7 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  40.52 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  29.61 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  33.81 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  36.15 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  38.71 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  34.35 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  33.59 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  33.59 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  33.59 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  31.5 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  30.89 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  33.59 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  32.19 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  30.89 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  34.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  32.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  37.76 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  30.65 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  40 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  30.6 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  32.38 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>