64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1652 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  56.77 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  45.81 
 
 		 269 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  45.81 
 
 		 269 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  45.81 
 
 		 269 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  46.25 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  46.5 
 
 		 212 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  45.57 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  45.86 
 
 		 213 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  45.22 
 
 		 213 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  45.16 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  44.3 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  45.57 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  45.57 
 
 		 214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  45.57 
 
 		 214 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  47.13 
 
 		 191 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  44.94 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  43.04 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  41.21 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  47.92 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  47.92 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  47.77 
 
 		 191 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  41.1 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  47.48 
 
 		 196 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  41.21 
 
 		 304 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  44.38 
 
 		 290 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  38.96 
 
 		 253 aa  104  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  42.5 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  38.96 
 
 		 253 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  35.67 
 
 		 252 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  37.18 
 
 		 205 aa  97.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  38.04 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  35.85 
 
 		 257 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  47.86 
 
 		 185 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  39.13 
 
 		 220 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  37.3 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  33.56 
 
 		 575 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  32.05 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  37.61 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  34.43 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  40.65 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  40.65 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  40.65 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  40.65 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  26.48 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  30.17 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  34.75 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  31.21 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  29.59 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  32.81 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  38.66 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  32.28 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  35.66 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  35.43 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  28.85 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  29.25 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  30.5 
 
 		 192 aa  51.2  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  31.52 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  47.73 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>