46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0984 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  51.35 
 
 
252 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  50.44 
 
 
253 aa  224  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  50.44 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  56.25 
 
 
213 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  55.4 
 
 
213 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  56.2 
 
 
212 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  56.2 
 
 
213 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  54.35 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  54.35 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  54.29 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  54.29 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  36.65 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  36.65 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  36.65 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  42.28 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  50.38 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  50.38 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  41.73 
 
 
171 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  39.13 
 
 
158 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  40 
 
 
304 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  34.56 
 
 
290 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  31.07 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  32.79 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  36.94 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  28.47 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  32.14 
 
 
257 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  43.84 
 
 
173 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  32.28 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  28.7 
 
 
160 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  29.49 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  46.15 
 
 
107 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  28.7 
 
 
160 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  24.77 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  35.05 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  26.61 
 
 
160 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  37.7 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  32.05 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  38.33 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  30.93 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  27.78 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0605553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>