34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1584 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  361  4e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  41.99 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  30.22 
 
 
168 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  32.09 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  28.85 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  31.67 
 
 
192 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  27.88 
 
 
269 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  27.88 
 
 
269 aa  58.2  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  27.88 
 
 
269 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  26.92 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  28.46 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  28.7 
 
 
252 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  27.93 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  25.2 
 
 
196 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  26.92 
 
 
214 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  51.6  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  51.6  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  26.92 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  26 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  25.52 
 
 
173 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  24.06 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  24.77 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
191 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  25.55 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  25.23 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  25.23 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  27.88 
 
 
304 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  34.62 
 
 
290 aa  40.8  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0236568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>