51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2671 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  66.3 
 
 		 182 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  66.3 
 
 		 182 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  47.48 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  33.14 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  28.74 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  35.81 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  30.81 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  30.81 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  30.81 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  30.22 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  29.28 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  32.95 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  28.73 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  28.18 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  27.06 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  28.89 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  27.87 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  31.21 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  28.18 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  30.5 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  27.62 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  29.49 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  27.78 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  30.34 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  29.45 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  31.03 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  29.22 
 
 		 575 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  25.2 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  31.43 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  28.26 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  26 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  28.74 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  24.31 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  31.71 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  28.29 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  32.05 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  32.73 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  26.28 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  27.98 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  27.98 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  27.98 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  27.98 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  25 
 
 		 304 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  25.81 
 
 		 290 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  31.9 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>