66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2985 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  47.67 
 
 
213 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  47.4 
 
 
214 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  47.37 
 
 
212 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  46.24 
 
 
214 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  47.34 
 
 
213 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  46.51 
 
 
214 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  46.51 
 
 
213 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  46.2 
 
 
213 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  43.21 
 
 
269 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  43.21 
 
 
269 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  43.21 
 
 
269 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  47.53 
 
 
191 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  47.53 
 
 
191 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  36.9 
 
 
252 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  41.1 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  39.75 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  39.75 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  37.57 
 
 
209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  41.73 
 
 
220 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  37.8 
 
 
290 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  35.09 
 
 
205 aa  94.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  37.74 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  37.13 
 
 
304 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  35.4 
 
 
160 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  31.36 
 
 
260 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  36.65 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  32.73 
 
 
575 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  36.75 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  29.65 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  34.91 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  33.14 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  33.54 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  32.89 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  30.22 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  33.72 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  38.13 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  36.61 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  33.53 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  26.98 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  32.93 
 
 
203 aa  60.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  32.03 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  31.43 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  30.91 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  29.9 
 
 
192 aa  57.8  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  28.21 
 
 
225 aa  55.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  33.64 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  27.68 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1360  hypothetical protein  33.64 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00314965  hitchhiker  7.76106e-17 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  27.03 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  29.45 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  28.41 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  29.21 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  28.26 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0129  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.164757  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2943  protein of unknown function DUF847  45.24 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>