23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0276 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  43.24 
 
 
185 aa  141  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  39.89 
 
 
185 aa  125  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  32.47 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  31.3 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  31.3 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  28.11 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  28.11 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  28.11 
 
 
269 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  23.33 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  27.59 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  28.18 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  28.18 
 
 
214 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  28.18 
 
 
214 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  29.25 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  27.27 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  27.03 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  23.89 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  28.44 
 
 
213 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  23.91 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  28.7 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  27.74 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  36.07 
 
 
191 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>