37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3063 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  43.23 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  34.93 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  38.46 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  38.46 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  38.46 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  38.29 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  37.71 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  37.71 
 
 		 212 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  34.57 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  38.79 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  37.5 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  37.57 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  40.24 
 
 		 191 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  37.93 
 
 		 213 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  36.36 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  36.36 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  36.36 
 
 		 214 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  33.54 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  33.54 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  42.45 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  31.36 
 
 		 171 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  34.32 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  32.79 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  32.05 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  35.4 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  24.44 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  29.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  28.75 
 
 		 160 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  34.44 
 
 		 173 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  30.14 
 
 		 160 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  27.5 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  28.85 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  33.77 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>