More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5187 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  72.93 
 
 		 596 aa  787    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  73.61 
 
 		 583 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  73.16 
 
 		 586 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  75.36 
 
 		 596 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  82.76 
 
 		 585 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1118    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  41.62 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  44.29 
 
 		 605 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  43.08 
 
 		 628 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  38.75 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 		 599 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  38.26 
 
 		 625 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  40.41 
 
 		 603 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  38.04 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  39.17 
 
 		 568 aa  346  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  35.37 
 
 		 614 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 594 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  35.59 
 
 		 600 aa  286  8e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.08 
 
 		 610 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  30.62 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  33.8 
 
 		 613 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  28 
 
 		 564 aa  256  9e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  29.05 
 
 		 599 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.52 
 
 		 564 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 613 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.66 
 
 		 601 aa  243  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.22 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.87 
 
 		 564 aa  242  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  29.48 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  27.11 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  41.04 
 
 		 626 aa  236  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  29.3 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  36.46 
 
 		 606 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  31.3 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  31.16 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  30.67 
 
 		 607 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  31.16 
 
 		 611 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  43.79 
 
 		 601 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  25.89 
 
 		 576 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  40.37 
 
 		 591 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  28.92 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  39.32 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  31.38 
 
 		 600 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.62 
 
 		 575 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  45.73 
 
 		 602 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 596 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  38.14 
 
 		 578 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.95 
 
 		 586 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.57 
 
 		 613 aa  207  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  43.07 
 
 		 582 aa  207  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  43.29 
 
 		 578 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.68 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.14 
 
 		 556 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.52 
 
 		 567 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  43.83 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.33 
 
 		 567 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  43.83 
 
 		 605 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  43.23 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  31.35 
 
 		 597 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  46.61 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.77 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  33.19 
 
 		 655 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  40.33 
 
 		 971 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0731  ABC transporter related  42.28 
 
 		 605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  43.9 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.92 
 
 		 610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4995  ABC transporter, transmembrane region  43.4 
 
 		 605 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0356136  normal  0.528337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  40.87 
 
 		 590 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  41.81 
 
 		 976 aa  200  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  48.46 
 
 		 580 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.97 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  36.47 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  31.86 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  40.26 
 
 		 975 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  48.46 
 
 		 580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.32 
 
 		 600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  40.07 
 
 		 585 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.18 
 
 		 610 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  28.37 
 
 		 592 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.61 
 
 		 586 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  36.13 
 
 		 631 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.81 
 
 		 608 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  32.58 
 
 		 612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  36.13 
 
 		 596 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.75 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  36.13 
 
 		 596 aa  197  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  31.52 
 
 		 602 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  42.23 
 
 		 1024 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.56 
 
 		 1003 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  32.98 
 
 		 662 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  32.98 
 
 		 663 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  37.5 
 
 		 870 aa  196  8.000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  34.5 
 
 		 727 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  44.49 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.66 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  41.13 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  41.99 
 
 		 644 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.74 
 
 		 582 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>