216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4706 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  96.82 
 
 
371 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
377 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  82.98 
 
 
380 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  83.24 
 
 
380 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  91.01 
 
 
378 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  87.21 
 
 
376 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  74.46 
 
 
374 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  76.5 
 
 
373 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  72.3 
 
 
378 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  76.66 
 
 
374 aa  537  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  76.5 
 
 
373 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  76.52 
 
 
373 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  76.64 
 
 
374 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  64.88 
 
 
378 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  60.54 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  59.68 
 
 
371 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  58.24 
 
 
371 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  54.22 
 
 
384 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  54.3 
 
 
370 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  53.8 
 
 
386 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  54.26 
 
 
368 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  54.78 
 
 
365 aa  361  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  52.7 
 
 
366 aa  359  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  52.75 
 
 
398 aa  352  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 
368 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  52.46 
 
 
398 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  52.41 
 
 
373 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  50.79 
 
 
386 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  53.87 
 
 
370 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 
373 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  53.04 
 
 
375 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  52.76 
 
 
377 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  51.5 
 
 
364 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  52.17 
 
 
367 aa  343  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  47.99 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  52.76 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  52 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  52.28 
 
 
363 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  52.17 
 
 
363 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  52.01 
 
 
363 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  51.43 
 
 
357 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  53.31 
 
 
371 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 
413 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 
366 aa  338  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  50.94 
 
 
371 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  52.19 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
371 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  50.58 
 
 
369 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  46.94 
 
 
369 aa  332  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.95 
 
 
365 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  50.68 
 
 
367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  52.2 
 
 
367 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  49.15 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  51.19 
 
 
378 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  53.2 
 
 
374 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.82 
 
 
376 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  45.84 
 
 
367 aa  311  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  48.24 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  44.41 
 
 
372 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  46.85 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  50.14 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 
369 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
369 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  45.75 
 
 
369 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  49.29 
 
 
370 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  47.7 
 
 
362 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.97 
 
 
369 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  46.79 
 
 
392 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
369 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  45.19 
 
 
371 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 
372 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 
377 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.11 
 
 
401 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 
371 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  42.97 
 
 
366 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 
390 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
391 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  46.07 
 
 
391 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  45.92 
 
 
386 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  45.8 
 
 
391 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  45.55 
 
 
392 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  46.01 
 
 
377 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46.55 
 
 
369 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46.55 
 
 
369 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.48 
 
 
369 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
397 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
401 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
400 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
400 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  46.22 
 
 
394 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  46.82 
 
 
369 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  46.5 
 
 
401 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 
397 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 
401 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  44.14 
 
 
363 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  45.18 
 
 
394 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  45.18 
 
 
392 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  47.04 
 
 
351 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  45.12 
 
 
370 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>