243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2311 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 623 aa  1207    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  75.04 
 
 		 623 aa  841    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  58.18 
 
 		 632 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  58.18 
 
 		 632 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  58.33 
 
 		 632 aa  608  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  49.37 
 
 		 618 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  51.49 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  39.23 
 
 		 623 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  38.59 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.1 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  42.16 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  38.5 
 
 		 622 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  38.12 
 
 		 623 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  36.78 
 
 		 619 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  37.21 
 
 		 626 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  37.14 
 
 		 613 aa  334  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 		 637 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  30.75 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.83 
 
 		 727 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.82 
 
 		 647 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.08 
 
 		 588 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 631 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 		 640 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 858 aa  101  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 858 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.67 
 
 		 566 aa  100  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  25.64 
 
 		 641 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.88 
 
 		 920 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  25.64 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 484 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  24.74 
 
 		 640 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 486 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  29.29 
 
 		 640 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  27.65 
 
 		 680 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.78 
 
 		 657 aa  93.6  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 846 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  25.48 
 
 		 818 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.19 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 657 aa  90.9  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.45 
 
 		 696 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 		 548 aa  88.6  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 		 525 aa  87.8  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 		 547 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.29 
 
 		 471 aa  87.4  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 		 493 aa  87.4  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 		 690 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  87.4  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  87  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  25.84 
 
 		 665 aa  87  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  87  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  28.7 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.52 
 
 		 683 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  28.7 
 
 		 547 aa  87  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.74 
 
 		 585 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  21.17 
 
 		 847 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  25.84 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 537 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 		 709 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 553 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  26.85 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  24.74 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  23.96 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  25.68 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.51 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 		 637 aa  79.7  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>