More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0315 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  77.85 
 
 		 578 aa  770    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 580 aa  1129    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  42.58 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  40.82 
 
 		 571 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  38.05 
 
 		 577 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  38.95 
 
 		 572 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  37.92 
 
 		 564 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  39.38 
 
 		 574 aa  316  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  40.51 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  39.78 
 
 		 553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  36.43 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 592 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  37.46 
 
 		 589 aa  299  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 561 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 		 547 aa  281  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  38.69 
 
 		 575 aa  280  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.1 
 
 		 575 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  38.92 
 
 		 575 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1968  adenylate/guanylate cyclase  37.55 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  35.83 
 
 		 364 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.85 
 
 		 584 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.12 
 
 		 638 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 861 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  37.57 
 
 		 670 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 		 584 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  40.24 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  35.06 
 
 		 860 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.77 
 
 		 614 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.57 
 
 		 358 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.39 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 		 911 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 		 903 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.33 
 
 		 585 aa  94  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 407 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.92 
 
 		 797 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 		 864 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 		 859 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 607 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.93 
 
 		 701 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  32.81 
 
 		 546 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.92 
 
 		 701 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 		 858 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1093 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  29.74 
 
 		 717 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.53 
 
 		 411 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 		 1207 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 645 aa  89.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  40.91 
 
 		 411 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  36.2 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 		 746 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 483 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.02 
 
 		 656 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  37.17 
 
 		 427 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 		 756 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  35.98 
 
 		 400 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.02 
 
 		 618 aa  87  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30 
 
 		 757 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  30.04 
 
 		 1134 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.41 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 744 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  35.44 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.28 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 712 aa  84  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.67 
 
 		 723 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  35.64 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.7 
 
 		 936 aa  83.6  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 		 536 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.26 
 
 		 758 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 731 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.52 
 
 		 611 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.09 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 701 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 		 696 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.52 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.25 
 
 		 971 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  35.87 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.15 
 
 		 735 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.97 
 
 		 744 aa  82  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.43 
 
 		 643 aa  81.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 591 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.65 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>