More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3190 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3190  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  751    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.63 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.17 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.24 
 
 		 401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.06 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.59 
 
 		 444 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.95 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.08 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.49 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.54 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  27.44 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.73 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.82 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.99 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  25.81 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.33 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.72 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.1 
 
 		 424 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  25.34 
 
 		 420 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.27 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.09 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.45 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.42 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  25.75 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  27.04 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  25 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.45 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.13 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.01 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.13 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.22 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  24.73 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.8 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  23.85 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  24.48 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  24.73 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.66 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0325  hypothetical protein  30.12 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  24.71 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.93 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2424  hypothetical protein  28.48 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.07 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  24.04 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0347  hypothetical protein  29.34 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.04 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 403 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.59 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.59 
 
 		 403 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2570  hypothetical protein  28.18 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.99 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.59 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4516  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.98 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.66 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.32 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.76 
 
 		 452 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  24.59 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  28.99 
 
 		 394 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  25 
 
 		 420 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.14 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.75 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.07 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.81 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.72 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.51 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.22 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.7 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.01 
 
 		 402 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.41 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.51 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.58 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.86 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.33 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4139  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.956348  normal  0.0272959 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0774  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.3 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2900  hypothetical protein  27.64 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2359  hypothetical protein  24.93 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.84 
 
 		 469 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  24.93 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
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NC_008391  Bamb_3946  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.9 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  27.39 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  24.73 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.93 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.57 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  27.22 
 
 		 410 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  23.24 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  27.39 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.35 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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