More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0897 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  926    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  57.89 
 
 
440 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  48.65 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  45.76 
 
 
544 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  45.2 
 
 
556 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  43.95 
 
 
567 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
548 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  45.74 
 
 
564 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  44.29 
 
 
560 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  42.66 
 
 
555 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 
546 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  42.95 
 
 
556 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
558 aa  362  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  42.31 
 
 
558 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  43.43 
 
 
556 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 
558 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  43.85 
 
 
555 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  42.73 
 
 
556 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  42.63 
 
 
550 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  42.08 
 
 
555 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  42.99 
 
 
556 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.66 
 
 
557 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 
556 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
548 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  42.38 
 
 
556 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  42.83 
 
 
557 aa  345  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  42.38 
 
 
557 aa  343  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  42.08 
 
 
556 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  42.16 
 
 
557 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  41.53 
 
 
542 aa  342  1e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  40.73 
 
 
557 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  43.21 
 
 
557 aa  339  7e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.95 
 
 
558 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  42.43 
 
 
557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  43.1 
 
 
560 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  40.74 
 
 
556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  42.22 
 
 
556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  38.39 
 
 
544 aa  322  7e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  39.29 
 
 
544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  41.12 
 
 
556 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  40.36 
 
 
556 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  37.1 
 
 
540 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  37.53 
 
 
556 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
558 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  35.65 
 
 
555 aa  289  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  36.3 
 
 
555 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  36.07 
 
 
560 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 
555 aa  282  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  36.67 
 
 
569 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 
558 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 
557 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.18 
 
 
557 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  36.59 
 
 
558 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
557 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 
554 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  36.38 
 
 
558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  32.74 
 
 
555 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 
593 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.41 
 
 
555 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.41 
 
 
555 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 
554 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
618 aa  266  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  36.04 
 
 
564 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  33.94 
 
 
556 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  35.36 
 
 
533 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  32.4 
 
 
555 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 
554 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 
572 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
560 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
550 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  36.88 
 
 
554 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  34.54 
 
 
558 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
553 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
559 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
558 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.65 
 
 
561 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  31.31 
 
 
557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18611  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  34.46 
 
 
662 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.08 
 
 
557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1744  hypothetical protein  34.68 
 
 
660 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18421  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  34.46 
 
 
661 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
566 aa  253  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 
551 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 
590 aa  252  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
557 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 
553 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  32.14 
 
 
573 aa  252  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.86 
 
 
557 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 
550 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  34.22 
 
 
547 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  32.27 
 
 
553 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
546 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  32.74 
 
 
662 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  30.86 
 
 
557 aa  250  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  34.99 
 
 
546 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>