More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1759 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  81.95 
 
 
397 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  81.11 
 
 
399 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
397 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
397 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  92.95 
 
 
397 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  92.7 
 
 
397 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.8 
 
 
398 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.05 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.74 
 
 
397 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.92 
 
 
398 aa  591  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.18 
 
 
400 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.28 
 
 
398 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.93 
 
 
398 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0920452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.93 
 
 
399 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  70.43 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.05 
 
 
400 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.1 
 
 
384 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.66 
 
 
386 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  48.31 
 
 
385 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
387 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  47.68 
 
 
385 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.15 
 
 
387 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
385 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.4 
 
 
385 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
385 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
385 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
386 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.95 
 
 
383 aa  359  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  46.88 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  47.53 
 
 
385 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.02 
 
 
391 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.26 
 
 
386 aa  345  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.86 
 
 
386 aa  332  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  44.85 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.64 
 
 
374 aa  295  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.82 
 
 
379 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  41.71 
 
 
380 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.6 
 
 
379 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.6 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.41 
 
 
379 aa  285  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.49 
 
 
385 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 
386 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.99 
 
 
380 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  41.52 
 
 
400 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.19 
 
 
394 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.12 
 
 
381 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  41.34 
 
 
388 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.86 
 
 
388 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
379 aa  276  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.3 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0815  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0634302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.44 
 
 
402 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.19 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.36 
 
 
560 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  273  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  41.75 
 
 
381 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.65 
 
 
380 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.47 
 
 
379 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  40.87 
 
 
560 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
381 aa  271  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.47 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  38.95 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.49 
 
 
381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.52 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
379 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.38 
 
 
375 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  39.69 
 
 
375 aa  269  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 
389 aa  269  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  39.69 
 
 
379 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.42 
 
 
528 aa  269  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.86 
 
 
381 aa  268  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.12 
 
 
379 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.98 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.05 
 
 
390 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
379 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
379 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  39.43 
 
 
375 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.7 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.47 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.69 
 
 
568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
379 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.84 
 
 
376 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  40.1 
 
 
551 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.21 
 
 
392 aa  266  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
379 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
379 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.47 
 
 
379 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.64 
 
 
381 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  39.69 
 
 
379 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>