108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3112 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3112  cytochrome c  100 
 
 		 135 aa  286  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.348322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  33.94 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  26.12 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1235  cytochrome c family protein  30.91 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3475  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 281 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4405  cytochrome c class I  29.52 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1708  putative cytochrome c  33.75 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  35.44 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4582  cytochrome c class I  34.18 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  27.41 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  26.15 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911024 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  29.2 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  25.44 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  29.13 
 
 		 199 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  27.62 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  27.36 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  33.02 
 
 		 308 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0404  cytochrome c, class I  31.91 
 
 		 427 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 329 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  31.31 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  27.19 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  28.72 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  28.72 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  28.95 
 
 		 236 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  34.25 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3474  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3076  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3648  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.238166  normal  0.256494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  25.64 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  28.07 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  30.28 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  29.59 
 
 		 342 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3864  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.166005  normal  0.942386 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  28.18 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_004310  BR0039  cytochrome c, membrane-bound  29.63 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.450907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  25.71 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3474  cytochrome c, class I  25 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0039  cytochrome c, membrane-bound  29.63 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  25 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  26.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  28.7 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  26.09 
 
 		 474 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  28.04 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  27.84 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  26.67 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  27.73 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  25.44 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  28.04 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  23.81 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  28.97 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1946  cytochrome c, class I  25.21 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0100  cytochrome c class I  29.76 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102431  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3553  cytochrome c, class I  26.51 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  25.22 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  25.22 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3913  cytochrome c class I  27.56 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0488  cytochrome c, class I  28.32 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3169  cytochrome c2  28.57 
 
 		 126 aa  43.9  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1307  cytochrome c, class I  26.28 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.806426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 426 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  24.53 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3205  cytochrome c class I  26.47 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  25.71 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6426  cytochrome c2  24.46 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  29.36 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  26.79 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  28.04 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  30.7 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  24.76 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  27.84 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1677  cytochrome C2  23.53 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  29.25 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>