More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1223 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
531 aa  1054    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  74.29 
 
 
535 aa  794    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  47.61 
 
 
535 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  45.08 
 
 
559 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  45.3 
 
 
556 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  46.41 
 
 
534 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 
551 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 
551 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 
544 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 
551 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 
551 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  45.49 
 
 
547 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  45.38 
 
 
542 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  44.44 
 
 
553 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 
528 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  46.45 
 
 
547 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  46.26 
 
 
547 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  45.87 
 
 
545 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 
545 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.47 
 
 
528 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  47.02 
 
 
552 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  45.54 
 
 
529 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  42.72 
 
 
542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  44.68 
 
 
527 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  45.4 
 
 
541 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  44.79 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.69 
 
 
524 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 
523 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.58 
 
 
545 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
520 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.38 
 
 
565 aa  143  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1236  potassium efflux system protein  28.82 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  28.49 
 
 
589 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.11 
 
 
561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.31 
 
 
617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 
566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  28.05 
 
 
589 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  23.4 
 
 
566 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  27.42 
 
 
561 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.28 
 
 
543 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.72 
 
 
589 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.57 
 
 
608 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  27.52 
 
 
604 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1166  potassium efflux system protein  27.24 
 
 
585 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  27.86 
 
 
589 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.79 
 
 
539 aa  124  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  27.34 
 
 
589 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  27.29 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  22.74 
 
 
566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0484  potassium efflux system protein  26.64 
 
 
604 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.09 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  23.67 
 
 
595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  25.72 
 
 
561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
649 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.35 
 
 
562 aa  118  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3045  potassium efflux system protein  27 
 
 
589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.268966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1305  potassium efflux system protein  27 
 
 
589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00534275  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 
660 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1341  potassium efflux system protein  26.5 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.92723  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 
558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1237  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.67 
 
 
608 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  25.78 
 
 
563 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  25.45 
 
 
558 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 
667 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  25.23 
 
 
558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  26.43 
 
 
649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  26.17 
 
 
664 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.59 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  27.56 
 
 
564 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26 
 
 
605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  27.54 
 
 
564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3041  potassium efflux system protein  28.6 
 
 
615 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.639601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
546 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.22 
 
 
669 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.81 
 
 
620 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.55 
 
 
620 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  26.67 
 
 
663 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 
581 aa  110  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.36 
 
 
620 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.16 
 
 
648 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0210  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, putative  27.35 
 
 
635 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.16 
 
 
648 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.16 
 
 
648 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  25.97 
 
 
566 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.36 
 
 
620 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  25.31 
 
 
558 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  25.78 
 
 
562 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.36 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.32 
 
 
635 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  25.38 
 
 
661 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 
661 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.36 
 
 
620 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0190  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.35 
 
 
614 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  25.31 
 
 
558 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>