124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1524 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  94 
 
 		 653 aa  1258    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  100 
 
 		 657 aa  1350    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  94.01 
 
 		 655 aa  1263    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  21.81 
 
 		 644 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  34.02 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  25.61 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  25.38 
 
 		 614 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  24.71 
 
 		 583 aa  92  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  26.38 
 
 		 588 aa  90.5  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  24.71 
 
 		 832 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  21.26 
 
 		 929 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  20.51 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.16 
 
 		 957 aa  71.6  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  21.16 
 
 		 634 aa  71.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  21.1 
 
 		 851 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  20.66 
 
 		 843 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  20.56 
 
 		 843 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  22.27 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  19.49 
 
 		 956 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  20 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  20.24 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  23.5 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  20.67 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.6 
 
 		 667 aa  64.3  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  20.12 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  19.68 
 
 		 944 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.23 
 
 		 921 aa  62.4  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  21.83 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  19.58 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  22.85 
 
 		 876 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.09 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  24.8 
 
 		 636 aa  56.6  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  24.52 
 
 		 636 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.91 
 
 		 960 aa  55.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  24.39 
 
 		 636 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  19.69 
 
 		 664 aa  53.9  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  26.64 
 
 		 726 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  19.91 
 
 		 707 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  24.39 
 
 		 636 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  22.88 
 
 		 699 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  18.76 
 
 		 660 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.69 
 
 		 930 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  23.04 
 
 		 846 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  24.71 
 
 		 830 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  29.09 
 
 		 706 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  24.9 
 
 		 634 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  24.9 
 
 		 634 aa  52.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  20 
 
 		 921 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  24.9 
 
 		 634 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  24.69 
 
 		 639 aa  52  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  27.93 
 
 		 669 aa  52  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0463  helicase c2  21.14 
 
 		 730 aa  51.2  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0718718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  24.32 
 
 		 643 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  28.38 
 
 		 669 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  20.8 
 
 		 664 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  19.26 
 
 		 664 aa  50.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  25.42 
 
 		 646 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  22.31 
 
 		 668 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  21.32 
 
 		 664 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  28.45 
 
 		 669 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 929 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  28.45 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  21.96 
 
 		 852 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  25.98 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  21.98 
 
 		 574 aa  48.9  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  22.49 
 
 		 640 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  20.25 
 
 		 729 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  20.47 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.36 
 
 		 720 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  47.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 934 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 934 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  21.29 
 
 		 665 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  18.82 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  22.92 
 
 		 646 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.69 
 
 		 707 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.8 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  31.86 
 
 		 822 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  21.78 
 
 		 713 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  23.55 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  30.21 
 
 		 773 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  24.23 
 
 		 674 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  23.44 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  20.85 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  25.38 
 
 		 653 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>