43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1084 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1084  rhomboid family protein  100 
 
 		 225 aa  431  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0579357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3129  rhomboid-like protein  28.23 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0489424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2653  rhomboid family protein  36.71 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  28.16 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2361  rhomboid family protein  30.41 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0440  rhomboid family protein  30.43 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0337816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2815  rhomboid family protein  33.47 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  32.64 
 
 		 315 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  26.38 
 
 		 362 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36.07 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  27.82 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  29.92 
 
 		 381 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  27.82 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1853  Rhomboid family protein  29.51 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0140086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3898  Rhomboid family protein  28.19 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  31.9 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  24.57 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5215  hypothetical protein  27.56 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  normal  0.0537832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.25 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1648  rhomboid-like protein  30.1 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3272  rhomboid-like protein  29.61 
 
 		 375 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00126234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  36.17 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  29.2 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0987  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.769886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  22.48 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  25.31 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2053  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2152  rhomboid-like protein  30.23 
 
 		 279 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896724  normal  0.106216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  30.99 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0720  Rhomboid family protein  32.48 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  30.19 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  34.48 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  24.07 
 
 		 267 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  29.58 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2202  hypothetical protein  28.97 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  31.54 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  27.61 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  27.21 
 
 		 360 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  27.21 
 
 		 360 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  26.45 
 
 		 219 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  29.87 
 
 		 219 aa  42  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  21.1 
 
 		 237 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>