70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05140 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
215 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  40.18 
 
 
211 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  38.62 
 
 
225 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  37.5 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  35.96 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  35.96 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  43.54 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  36.43 
 
 
243 aa  92  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  42.66 
 
 
229 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  42.66 
 
 
229 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  42.66 
 
 
229 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  38.79 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  35.29 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  30.73 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  38.51 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  42.31 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  41.55 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  35.76 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  36.08 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  37.5 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  32.72 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  34.57 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  33.92 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  44.29 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  28.11 
 
 
256 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  32.65 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  36.76 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  31.43 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  36.43 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  29.59 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  35.29 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  36.76 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  32.79 
 
 
211 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  38.1 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  34.1 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  38.18 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  35.16 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  31.75 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  31.84 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  39.31 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  31.34 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  39.41 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  33.56 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  39.57 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.09 
 
 
279 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  33.59 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  33.78 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.97 
 
 
381 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  36.76 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.11 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.12 
 
 
303 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.59 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  37.88 
 
 
303 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  29.37 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  37.59 
 
 
179 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  28.67 
 
 
376 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
386 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  36.25 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  32.82 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  26.36 
 
 
342 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  23.57 
 
 
486 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  36.22 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.69 
 
 
342 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0259  rhomboid-like protein  28.26 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  29.17 
 
 
225 aa  42  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  33.93 
 
 
298 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>